งานวิจัยเป็นภารกิจหลักอย่างหนึ่งของสถาบันอุดมศึกษา ในการสร้างความเป็นเลิศทางวิชาการ เป็นกลไกของการเรียนรู้การสร้างชื่อเสียง และการยอมรับของสังคม เพื่อเป็นการเพิ่มโอกาส และประสิทธิภาพงานวิจัยดังกล่าว คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี ได้สนับสนุนให้บุคลากร เสนอขอรับทุนจากแหล่งทุนต่าง ๆ ดังนี้

  1. โครงการวิจัยเงินงบประมาณแผ่นดิน เป็นโครงการวิจัยที่รัฐบาลโดยสำนักงบประมาณ จัดสรรให้กับหน่วยงานต่างๆ ตามระเบียบวิธีการงบประมาณ ในหมวดเงินอุดหนุนโครงการวิจัยของอาจารย์
  2. โครงการวิจัยเงินรายได้ของคณะ/มหาวิทยาลัย หรือทุนวิจัยวิทยาศาสตร์ ทุนวิจัยพระจอมเกล้าธนบุรี เป็นโครงการวิจัยเพื่อสนับสนุนนักวิจัยหน้าใหม่ และใช้ทุนวิจัยนี้เป็นจุดเริ่มต้น เพื่อเป็นฐานของโครงการวิจัย ซึ่งมีโอกาสพัฒนาเป็นโครงการใหญ่ สามารถนำผลงานเบื้องต้นนี้ ไปขอทุนวิจัยอื่นในอนาคต
  3. โครงการวิจัยจากแหล่งทุนภายนอก เป็นทุนอุดหนุนการวิจัยจากภาคเอกชน หรือทุนอุดหนุนวิจัยอื่น ๆ จากงบประมาณของรัฐบาล

กลุ่มงานวิจัย

      คณะวิทยาศาสตร์ ได้รวบรวมกลุ่มงานวิจัยที่ทำงานคล้ายคลึง และเกี่ยวข้องเข้าด้วยกันเพื่อกำหนดทิศทางการวิจัย และเป็นการพัฒนาศักยภาพของกลุ่มงานวิจัย ให้มีความแข้มแข็ง ขณะนี้มีอยู่ด้วยกัน 20 กลุ่มงานวิจัย ใน 4 ภาควิชาดังต่อไปนี้

ภาควิชาจุลชีววิทยา

 
  • Food Safety and Quality Improvement
  • Agricultural and Applied Microbiology
  • Food Product Development
  • Waste Utilization and Management

ภาควิชาฟิสิกส์

 
  • Optics and Laser Technology
  • Scintillation Crystals for Science and Technology
  • Thin Film Technology
  • Synthesis Materials and Applications

ภาควิชาคณิตศาสตร์

 
  • The Atmospheric and Oceanic Modeling
  • Numerical Analysis
  • Environmental Management
  • Computer-aid Instruction
  • Computer for Business Applied Statistics
  • Computational Mathematics
  • Nonlinear Analysis and Optimization
  • Fixed Point Theory and Applications
  • Applied Statistics and Risk
  • Combinatorics and Graph Theory

ภาควิชาเคมี

 
  • Environmental Technology and Management Polymer
  • Organic Synthesis and Natural Products
  • Computational Chemistry
  • Nanomaterials Analytical Chemistry